김개발의 생명정보학

설치 환경: Ubuntu 20.04.1 LTS Database: MySQL , 5.5.68-MariaDB 설치하는 부분 외에는 mysql이랑 mariadb랑 별 차이가 없다. 명령어 거의 다 똑같음... 심지어 mariadb 접속조차도 mysql -u root -p로 mysql이랑 똑같음.. 1. apt-get update $ sudo apt-get update 2. mysql-server 설치 $ sudo apt-get install mysql-server 3. 기본 세팅 # 외부접속 포트 열기(default:3306) $ sudo ufw allow mysql # mysql 실행 $ sudo sytemctl start mysql # 실행확인 $ ps -ef | grep mysql # ubuntu 시작 ..

현재 설정되어 있는 PATH 확인 [root]$ echo $PATH bashrc을 수정해서 PATH 추가 [root]$ sudo vi ~/.bashrc 맨 아랫줄에 위 내용 추가 PATH=$PATH:원하는 경로 terminal에 반영 [root]$ source ~/.bashrc +) 프로그램 설치 경로와 관계 없이 실행할 수 있도록 설정 프로그램 예시 : ex_program 아래와 같이 입력하면 경로 상관없이 ex_program 으로 프로그램 실행 가능 [root]$ sudo ln -s /home/utils/ex_program /usr/local/bin/ex_program

R을 사용할 conda env 생성 후, [root]$ conda create -n R_env [root]$ conda activate R_env R 사용을 위한 패키지 다운로드 (R_env)[root]$ conda install -c r r-essentials RStudio Server 설치 https://www.rstudio.com/products/rstudio/download-server/debian-ubuntu/ Install for Debian 10 / Ubuntu 18 / Ubuntu 20 [root]$ sudo apt-get install gdebi-core [root]$ wget https://download2.rstudio.org/server/bionic/amd64/rstudio-serv..