김개발의 생명정보학

Local에서 key 생성 $ cd ~/.ssh $ ls $ ssh-keygen -t rsa public key: remote 접속할 server의 .ssh/authorized_keys 파일 만들고 key 복붙 private key: ssh config의 IdentityFile에 해당 경로를 적어줌 vscode에서 remote ssh 설치하고 F1 누르고 ssh 쳐보면 관련 기능을 쓸 수 있음.. 경로 따라가기 귀찮아서 ssh config 파일도 vscode에서 Open SSH configuration file 기능으로 불러와서 수정하는 편이다 Host lab_ubuntu HostName xxx.xxx.x.xxx User username Port 22 IdentityFile ~/.ssh/id_rsa 이런..

bash script로 slurm에 job 던지기 [USER@login1]$ cat submission.sh #!/bin/bash #SBATCH --nodes=1 srun jupyter nbconvert --to notebook --execute mynotebook.ipynb [USER@login1]$ sbatch submission.sh command에서 바로 명령어 날려서 실행시키기 [USER@login1]$ conda activate my_env (my_env)[USER@login1]$ srun jupyter nbconvert --to notebook --execute mynotebook.ipynb sinfo $ sinfo PARTITION AVAIL TIMELIMIT NODES STATE NODE..

현재 설정되어 있는 PATH 확인 [root]$ echo $PATH bashrc을 수정해서 PATH 추가 [root]$ sudo vi ~/.bashrc 맨 아랫줄에 위 내용 추가 PATH=$PATH:원하는 경로 terminal에 반영 [root]$ source ~/.bashrc +) 프로그램 설치 경로와 관계 없이 실행할 수 있도록 설정 프로그램 예시 : ex_program 아래와 같이 입력하면 경로 상관없이 ex_program 으로 프로그램 실행 가능 [root]$ sudo ln -s /home/utils/ex_program /usr/local/bin/ex_program